MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070017 complete genome

Total Repeats: 101347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019952	CGT	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633013
2	NC_019952	CAC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633013
3	NC_019952	GTC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633013
4	NC_019952	GAC	2	6	372	377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
5	NC_019952	CAG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
6	NC_019952	TCG	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633013
7	NC_019952	AGC	2	6	492	497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
8	NC_019952	GCC	2	6	553	558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
9	NC_019952	CCG	2	6	597	602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
10	NC_019952	CGAC	2	8	604	611	25 %	0 %	25 %	50 %	433633013
11	NC_019952	CGA	2	6	617	622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
12	NC_019952	GCC	2	6	632	637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
13	NC_019952	ACG	2	6	682	687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
14	NC_019952	TGA	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633013
15	NC_019952	CGTT	2	8	820	827	0 %	50 %	25 %	25 %	433633013
16	NC_019952	CGC	3	9	854	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
17	NC_019952	CCCG	2	8	882	889	0 %	0 %	25 %	75 %	433633013
18	NC_019952	AC	3	6	936	941	50 %	0 %	0 %	50 %	433633013
19	NC_019952	GGCA	2	8	953	960	25 %	0 %	50 %	25 %	433633013
20	NC_019952	GTT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633013
21	NC_019952	CGA	2	6	1103	1108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
22	NC_019952	TTC	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633013
23	NC_019952	CAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633013
24	NC_019952	TCATC	2	10	1195	1204	20 %	40 %	0 %	40 %	433633013
25	NC_019952	CCCA	2	8	1211	1218	25 %	0 %	0 %	75 %	433633013
26	NC_019952	AGC	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
27	NC_019952	ACC	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633013
28	NC_019952	CGA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
29	NC_019952	CAG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633013
30	NC_019952	GC	3	6	1414	1419	0 %	0 %	50 %	50 %	433633013
31	NC_019952	GCG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633013
32	NC_019952	CCG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633013
33	NC_019952	CA	3	6	1701	1706	50 %	0 %	0 %	50 %	433633013
34	NC_019952	CAC	2	6	1784	1789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633013
35	NC_019952	CGTTT	2	10	2384	2393	0 %	60 %	20 %	20 %	433633014
36	NC_019952	GTGG	2	8	2424	2431	0 %	25 %	75 %	0 %	433633014
37	NC_019952	GCCA	2	8	2442	2449	25 %	0 %	25 %	50 %	433633014
38	NC_019952	CGGTGC	2	12	2456	2467	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433633014
39	NC_019952	GTT	2	6	2478	2483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
40	NC_019952	CCG	2	6	2534	2539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633014
41	NC_019952	TTG	2	6	2596	2601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
42	NC_019952	CGA	2	6	2699	2704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633014
43	NC_019952	TTG	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
44	NC_019952	ATT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433633014
45	NC_019952	TCAG	2	8	2786	2793	25 %	25 %	25 %	25 %	433633014
46	NC_019952	CGC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633014
47	NC_019952	GAC	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633014
48	NC_019952	GGT	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633014
49	NC_019952	CGT	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633014
50	NC_019952	GCC	2	6	2983	2988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633014
51	NC_019952	CGG	2	6	3000	3005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633014
52	NC_019952	CGTT	2	8	3012	3019	0 %	50 %	25 %	25 %	433633014
53	NC_019952	GCA	2	6	3086	3091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633014
54	NC_019952	CTT	2	6	3100	3105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633014
55	NC_019952	AC	3	6	3147	3152	50 %	0 %	0 %	50 %	433633014
56	NC_019952	CCA	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633014
57	NC_019952	GC	3	6	3224	3229	0 %	0 %	50 %	50 %	433633014
58	NC_019952	GAT	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633014
59	NC_019952	TTG	3	9	3308	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633014
60	NC_019952	ACGG	2	8	3364	3371	25 %	0 %	50 %	25 %	433633014
61	NC_019952	GCCT	2	8	3426	3433	0 %	25 %	25 %	50 %	433633014
62	NC_019952	CGG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633014
63	NC_019952	CGGTT	2	10	3533	3542	0 %	40 %	40 %	20 %	433633014
64	NC_019952	CGTC	2	8	3577	3584	0 %	25 %	25 %	50 %	433633015
65	NC_019952	TTG	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633015
66	NC_019952	CGA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
67	NC_019952	GGTA	2	8	3757	3764	25 %	25 %	50 %	0 %	433633015
68	NC_019952	GTG	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
69	NC_019952	ACG	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
70	NC_019952	CAA	2	6	3847	3852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633015
71	NC_019952	ATC	2	6	3868	3873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633015
72	NC_019952	TGT	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633015
73	NC_019952	GGTT	2	8	3939	3946	0 %	50 %	50 %	0 %	433633015
74	NC_019952	CGG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
75	NC_019952	GAT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633015
76	NC_019952	GT	3	6	4104	4109	0 %	50 %	50 %	0 %	433633015
77	NC_019952	TGG	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
78	NC_019952	CCGC	2	8	4167	4174	0 %	0 %	25 %	75 %	433633015
79	NC_019952	GAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633015
80	NC_019952	AGC	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
81	NC_019952	GGC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
82	NC_019952	GGC	2	6	4345	4350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
83	NC_019952	GAC	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
84	NC_019952	GGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
85	NC_019952	TGG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
86	NC_019952	GTT	2	6	4534	4539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633015
87	NC_019952	CGA	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633015
88	NC_019952	CGG	2	6	4593	4598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633015
89	NC_019952	CCG	2	6	4605	4610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633015
90	NC_019952	CCG	2	6	4650	4655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633015
91	NC_019952	GGT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633015
92	NC_019952	TGC	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633016
93	NC_019952	CG	5	10	4834	4843	0 %	0 %	50 %	50 %	433633016
94	NC_019952	GTCGG	2	10	4881	4890	0 %	20 %	60 %	20 %	433633016
95	NC_019952	CGA	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633016
96	NC_019952	GGT	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633016
97	NC_019952	CCA	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633016
98	NC_019952	ACG	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633016
99	NC_019952	CGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633016
100	NC_019952	CGG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633016
101	NC_019952	CG	3	6	5270	5275	0 %	0 %	50 %	50 %	433633016
102	NC_019952	AAG	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633017
103	NC_019952	GGT	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
104	NC_019952	CGA	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
105	NC_019952	TGC	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633017
106	NC_019952	CGA	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
107	NC_019952	CCAC	2	8	5791	5798	25 %	0 %	0 %	75 %	433633017
108	NC_019952	ACCG	2	8	5810	5817	25 %	0 %	25 %	50 %	433633017
109	NC_019952	GTG	2	6	5823	5828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
110	NC_019952	CGG	2	6	5846	5851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633017
111	NC_019952	TGG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
112	NC_019952	CGGCGT	2	12	5894	5905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433633017
113	NC_019952	GGT	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
114	NC_019952	CAAG	2	8	6005	6012	50 %	0 %	25 %	25 %	433633017
115	NC_019952	AAG	2	6	6024	6029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633017
116	NC_019952	CGCC	2	8	6101	6108	0 %	0 %	25 %	75 %	433633017
117	NC_019952	CAA	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633017
118	NC_019952	CGA	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
119	NC_019952	GTC	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633017
120	NC_019952	TGG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
121	NC_019952	AGC	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
122	NC_019952	GGC	2	6	6468	6473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633017
123	NC_019952	GC	3	6	6496	6501	0 %	0 %	50 %	50 %	433633017
124	NC_019952	GGT	2	6	6509	6514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633017
125	NC_019952	AAGGAC	2	12	6546	6557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	433633017
126	NC_019952	AGACCA	2	12	6640	6651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	433633017
127	NC_019952	GCG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633017
128	NC_019952	CGGC	2	8	6916	6923	0 %	0 %	50 %	50 %	433633017
129	NC_019952	ATC	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633017
130	NC_019952	GC	3	6	7002	7007	0 %	0 %	50 %	50 %	433633017
131	NC_019952	ATC	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633017
132	NC_019952	ACG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
133	NC_019952	TGT	2	6	7159	7164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633017
134	NC_019952	GTT	3	9	7169	7177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633017
135	NC_019952	CCG	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633017
136	NC_019952	CTG	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633017
137	NC_019952	GAA	2	6	7325	7330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633017
138	NC_019952	CAA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633017
139	NC_019952	ACC	2	6	7401	7406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633017
140	NC_019952	GT	3	6	7423	7428	0 %	50 %	50 %	0 %	433633017
141	NC_019952	GAC	2	6	7446	7451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633017
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143	NC_019952	GTT	2	6	7469	7474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633017
144	NC_019952	CG	3	6	7502	7507	0 %	0 %	50 %	50 %	433633017
145	NC_019952	GACA	2	8	7596	7603	50 %	0 %	25 %	25 %	433633018
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147	NC_019952	GAC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
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149	NC_019952	GCAGC	2	10	7665	7674	20 %	0 %	40 %	40 %	433633018
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152	NC_019952	CGGT	2	8	7816	7823	0 %	25 %	50 %	25 %	433633018
153	NC_019952	ACC	2	6	7844	7849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633018
154	NC_019952	TGG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633018
155	NC_019952	CGG	2	6	7964	7969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633018
156	NC_019952	CGA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
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161	NC_019952	ACG	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633018
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164	NC_019952	TCG	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
165	NC_019952	GTT	2	6	8359	8364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433633018
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174	NC_019952	GCT	2	6	8862	8867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633018
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242	NC_019952	TGC	2	6	12306	12311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633021
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244	NC_019952	GAGC	2	8	12384	12391	25 %	0 %	50 %	25 %	433633021
245	NC_019952	GGC	2	6	12400	12405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633021
246	NC_019952	CGG	2	6	12440	12445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633021
247	NC_019952	GAG	2	6	12502	12507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433633021
248	NC_019952	CTCA	2	8	12595	12602	25 %	25 %	0 %	50 %	433633021
249	NC_019952	ACG	2	6	12956	12961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633022
250	NC_019952	CGG	2	6	13029	13034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633022
251	NC_019952	CGA	2	6	13053	13058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633022
252	NC_019952	TCA	2	6	13142	13147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633022
253	NC_019952	GGT	2	6	13278	13283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633022
254	NC_019952	CAG	2	6	13515	13520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633023
255	NC_019952	C	6	6	13521	13526	0 %	0 %	0 %	100 %	433633023
256	NC_019952	GGC	2	6	13559	13564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633023
257	NC_019952	TCG	2	6	13579	13584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633023
258	NC_019952	GAT	2	6	13590	13595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433633023
259	NC_019952	AACC	2	8	13630	13637	50 %	0 %	0 %	50 %	433633023
260	NC_019952	GC	3	6	13681	13686	0 %	0 %	50 %	50 %	433633023
261	NC_019952	CCCG	2	8	13739	13746	0 %	0 %	25 %	75 %	433633023
262	NC_019952	TGC	2	6	13843	13848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633023
263	NC_019952	CAA	2	6	14027	14032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633024
264	NC_019952	AAC	2	6	14178	14183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433633024
265	NC_019952	ACCTTC	2	12	14211	14222	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	433633024
266	NC_019952	TTC	2	6	14259	14264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433633024
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268	NC_019952	GGCGT	2	10	14446	14455	0 %	20 %	60 %	20 %	433633025
269	NC_019952	TGCT	2	8	14474	14481	0 %	50 %	25 %	25 %	433633025
270	NC_019952	GCT	3	9	14488	14496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633025
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273	NC_019952	CCG	2	6	14533	14538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633025
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276	NC_019952	GCG	2	6	14680	14685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633025
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279	NC_019952	GGGCC	2	10	14729	14738	0 %	0 %	60 %	40 %	433633025
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281	NC_019952	CG	3	6	14787	14792	0 %	0 %	50 %	50 %	433633025
282	NC_019952	CAT	2	6	14896	14901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633025
283	NC_019952	TGC	2	6	14937	14942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633025
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285	NC_019952	CGC	2	6	14977	14982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633025
286	NC_019952	CGC	3	9	14992	15000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633025
287	NC_019952	GCT	2	6	15008	15013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633025
288	NC_019952	GAA	2	6	15080	15085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433633025
289	NC_019952	ACT	2	6	15162	15167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433633025
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291	NC_019952	ACC	2	6	15306	15311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433633026
292	NC_019952	GCC	2	6	15326	15331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633026
293	NC_019952	GC	3	6	15385	15390	0 %	0 %	50 %	50 %	433633026
294	NC_019952	GCA	2	6	15425	15430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633026
295	NC_019952	CA	3	6	15429	15434	50 %	0 %	0 %	50 %	433633026
296	NC_019952	GCGTT	2	10	15474	15483	0 %	40 %	40 %	20 %	433633026
297	NC_019952	CG	3	6	15500	15505	0 %	0 %	50 %	50 %	433633026
298	NC_019952	CAG	2	6	15529	15534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633026
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301	NC_019952	GGGC	2	8	15742	15749	0 %	0 %	75 %	25 %	433633026
302	NC_019952	CTG	2	6	15775	15780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633026
303	NC_019952	GAC	2	6	15794	15799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433633026
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345	NC_019952	GGT	2	6	17754	17759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633027
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372	NC_019952	GGT	2	6	18860	18865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433633028
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380	NC_019952	TTAGC	2	10	19329	19338	20 %	40 %	20 %	20 %	433633029
381	NC_019952	CG	3	6	19357	19362	0 %	0 %	50 %	50 %	433633029
382	NC_019952	GCT	2	6	19365	19370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633029
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384	NC_019952	GGTCC	2	10	19401	19410	0 %	20 %	40 %	40 %	433633029
385	NC_019952	GCC	2	6	19447	19452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633029
386	NC_019952	GCG	2	6	19535	19540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433633029
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388	NC_019952	TGC	2	6	19626	19631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433633029
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500	NC_019952	GCC	2	6	24453	24458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433633033

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